Le Rucher des 3 Seigneurs se trouve dans les Pyrénées ariégeoises, dans le canton du Haut Couserans, à 20 km de Saint Girons et de Tarascon/Ariège, dans le petit village de Le Port, à 5 km de Massat.

L'exploitation est située à 900 mètres d'altitude, près du site de l'étang de Lers, du village de Goutets et du pic des 3 Seigneurs.